21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2903 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  92.61 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  58.29 
 
 		 170 aa  225  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  48.66 
 
 		 170 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  50.53 
 
 		 170 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  46.56 
 
 		 170 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  43.27 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  43.27 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.24 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.24 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  34.51 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  30.16 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  28.43 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  27.45 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>