15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2973 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  100 
 
 		 170 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  87.57 
 
 		 170 aa  315  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  58.68 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  48.66 
 
 		 203 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  46.07 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  50.9 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.86 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.86 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  31.31 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  32.98 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  30.83 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  30.83 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>