32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3826 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  40.7 
 
 
178 aa  132  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  40.65 
 
 
170 aa  104  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  34.27 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  32.47 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  32.39 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  34.25 
 
 
169 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  31.25 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  31.25 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.56 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  30.14 
 
 
148 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
154 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  27.01 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  29.66 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  28.26 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  29.5 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  28.47 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  25.52 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  24.82 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  26.62 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  24.11 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  24.11 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 
168 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  25.9 
 
 
152 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
225 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
225 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>