More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1681 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
354 aa  722    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  45.05 
 
 
906 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
255 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  43.1 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  42.4 
 
 
290 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  47 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.12 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  40.57 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  42.25 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  43.56 
 
 
400 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  41.12 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  41.12 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  37.39 
 
 
844 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  41.12 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.34 
 
 
546 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  40.83 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  40.83 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 
620 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  34.76 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  39.45 
 
 
523 aa  72.8  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.4 
 
 
617 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.29 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  33.94 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  33.94 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 
547 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  29.09 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  36.72 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0140  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  36.09 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.01 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  35.33 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.96 
 
 
733 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  37.07 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  36.61 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  37.19 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
797 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.22 
 
 
515 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  35.4 
 
 
265 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.59 
 
 
534 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  35.4 
 
 
265 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  32 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 
527 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  35.94 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.48 
 
 
568 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  38.89 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  29.13 
 
 
423 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.28 
 
 
579 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  29.37 
 
 
619 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  35.78 
 
 
289 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.08 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
399 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.49 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  29.01 
 
 
515 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 
544 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 
548 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 
661 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.57 
 
 
514 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  29.36 
 
 
503 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  36.11 
 
 
266 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.9 
 
 
515 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  30.83 
 
 
498 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  32.76 
 
 
142 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  28.24 
 
 
515 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  27.08 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.2 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 
595 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  27.13 
 
 
495 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  37.96 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  47.56 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 
387 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.56 
 
 
285 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  32.41 
 
 
261 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.01 
 
 
465 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  31.3 
 
 
596 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.89 
 
 
554 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  28.12 
 
 
523 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 
519 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.44 
 
 
576 aa  59.7  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.54 
 
 
532 aa  59.7  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.48 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 
546 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 
517 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 
519 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  28.47 
 
 
524 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  28.67 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.06 
 
 
530 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  30.53 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  30.17 
 
 
515 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  26.72 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 
610 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  29.71 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>