254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1448 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
362 aa  726    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.47 
 
 
329 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  54.14 
 
 
906 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5779  hypothetical protein  50.69 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225562  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1781  hypothetical protein  50 
 
 
213 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0154  hypothetical protein  44.05 
 
 
201 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.76 
 
 
346 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 
447 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  49.59 
 
 
290 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  49.66 
 
 
387 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  34.82 
 
 
308 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  56.44 
 
 
378 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  37.2 
 
 
844 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.28 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  34.94 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  38.51 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  43.48 
 
 
559 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  43.48 
 
 
559 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  33.9 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  43.48 
 
 
559 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  45.95 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  51.43 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  52.13 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.36 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  36.02 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  29.04 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  37.91 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.56 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  44.79 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  33.11 
 
 
541 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  34.27 
 
 
175 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  40.57 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.31 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  56.52 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  32.11 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  40 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.31 
 
 
251 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.75 
 
 
434 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  30.8 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.98 
 
 
267 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  46.25 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  46.25 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.3 
 
 
252 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  45 
 
 
252 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  46.25 
 
 
242 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  46.25 
 
 
242 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  45 
 
 
252 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  45 
 
 
252 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  33.97 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  46.25 
 
 
212 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.86 
 
 
506 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  28.89 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  45 
 
 
249 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  45 
 
 
249 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  38.21 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  41.05 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.71 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  44 
 
 
263 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  40.7 
 
 
241 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  43.59 
 
 
298 aa  56.6  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  49.25 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.67 
 
 
662 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  33.57 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.05 
 
 
195 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 
260 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  38.38 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  38.38 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  43.37 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  31.34 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  38.38 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.86 
 
 
421 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.48 
 
 
289 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  38.1 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  38.1 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  28.25 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  40.7 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.04 
 
 
275 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3487  lytic murein transglycosylase B  43.48 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  hitchhiker  0.0000000197037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
318 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.78 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.03 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.86 
 
 
191 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 
522 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  44.44 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  26.11 
 
 
1048 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  50 
 
 
445 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.51 
 
 
215 aa  50.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.21 
 
 
235 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  45.76 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.73 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  45.76 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  45.76 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  40.28 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  45.76 
 
 
359 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>