38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_46 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  96.62 
 
 		 739 aa  1476    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  100 
 
 		 739 aa  1532    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06795  hypothetical protein  27.1 
 
 		 409 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2612  pesticin domain-containing protein  39.89 
 
 		 192 aa  134  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0732  pesticin domain-containing protein  40.68 
 
 		 185 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00113728  normal  0.116352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  26.21 
 
 		 859 aa  131  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  48.65 
 
 		 1017 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  28.81 
 
 		 969 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  27.42 
 
 		 960 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  28.34 
 
 		 963 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0021  pesticin  28.57 
 
 		 357 aa  101  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.750323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0007  pesticin  28.57 
 
 		 357 aa  101  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112425  normal  0.0257696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2070  hypothetical protein  27.88 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0775  flocculin repeat-containing protein  34.83 
 
 		 289 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.555697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2654  hypothetical protein  31.51 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  54.7  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  43.66 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1622  putative cell wall lytic enzyme  49.02 
 
 		 136 aa  53.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 307 aa  51.6  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  26.96 
 
 		 338 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  52.08 
 
 		 335 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 191 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 567 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.35 
 
 		 332 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  30.1 
 
 		 306 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.16 
 
 		 232 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 411 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30.63 
 
 		 283 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  33.04 
 
 		 303 aa  47.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 709 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 221 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  36.56 
 
 		 602 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  53.33 
 
 		 390 aa  45.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  42.31 
 
 		 179 aa  45.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  35.96 
 
 		 697 aa  44.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  44.68 
 
 		 192 aa  44.3  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>