57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1797 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  65.5 
 
 
960 aa  1309    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  100 
 
 
969 aa  2026    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  71.88 
 
 
963 aa  1454    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  49.11 
 
 
503 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  30.88 
 
 
859 aa  219  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06795  hypothetical protein  32.86 
 
 
409 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  28.81 
 
 
739 aa  108  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  32.54 
 
 
675 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  31.43 
 
 
698 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  26.23 
 
 
485 aa  101  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  33.33 
 
 
522 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  31.91 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  31.01 
 
 
1118 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  27.87 
 
 
739 aa  99  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  29.22 
 
 
453 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  28.77 
 
 
436 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 
615 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  30.3 
 
 
539 aa  94  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  29.13 
 
 
802 aa  93.2  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  29.21 
 
 
686 aa  91.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.82 
 
 
435 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  30.89 
 
 
1409 aa  89.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  28.42 
 
 
436 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  25.58 
 
 
513 aa  89  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  28.42 
 
 
308 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  29.89 
 
 
815 aa  80.9  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  28.65 
 
 
726 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  26.37 
 
 
530 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.75 
 
 
733 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  28.25 
 
 
577 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  28.25 
 
 
577 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  28.25 
 
 
577 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  27.75 
 
 
768 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  28.97 
 
 
462 aa  77.4  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  31.87 
 
 
791 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  27.07 
 
 
1892 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  31.63 
 
 
800 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  25.27 
 
 
882 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  30.72 
 
 
740 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  30.87 
 
 
357 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  29.34 
 
 
720 aa  54.7  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.86 
 
 
514 aa  54.7  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  25 
 
 
456 aa  53.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  29.15 
 
 
769 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  29.15 
 
 
769 aa  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  29.15 
 
 
802 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  35.24 
 
 
306 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  29.65 
 
 
802 aa  51.2  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  25.6 
 
 
349 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  30.43 
 
 
341 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  25.16 
 
 
530 aa  49.7  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  28.57 
 
 
349 aa  49.7  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  30.86 
 
 
1338 aa  48.5  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  27.81 
 
 
669 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  26.34 
 
 
753 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  26.34 
 
 
753 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  27.05 
 
 
420 aa  45.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>