12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2654 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59630  hypothetical protein  47.39 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103236  hitchhiker  1.5403300000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2612  pesticin domain-containing protein  29.44 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  32.19 
 
 		 739 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  31.51 
 
 		 739 aa  59.3  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0732  pesticin domain-containing protein  29.45 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00113728  normal  0.116352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2070  hypothetical protein  28.25 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2293  hypothetical protein  43.75 
 
 		 238 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  26.19 
 
 		 697 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0007  pesticin  23.68 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112425  normal  0.0257696 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0021  pesticin  23.68 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.750323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0775  flocculin repeat-containing protein  46.51 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.555697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>