25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1774 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  100 
 
 
697 aa  1410    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  47.64 
 
 
310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  47.12 
 
 
310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4026  EF hand domain-containing protein  44.1 
 
 
196 aa  158  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3854  putative cytoplasmic protein  42.96 
 
 
123 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587296  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  29.68 
 
 
889 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0467  putative cytoplasmic protein  40.44 
 
 
122 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2728  hypothetical protein  35.77 
 
 
122 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2617  hypothetical protein  35.77 
 
 
122 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2564  hypothetical protein  35.77 
 
 
122 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3260  putative cytoplasmic protein  42.02 
 
 
119 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01469  hypothetical protein  30.77 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2604  hypothetical protein  38.37 
 
 
72 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2093  hypothetical protein  31.43 
 
 
133 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0532  hypothetical protein  33.65 
 
 
241 aa  47.4  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000569067  unclonable  0.00000000103423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  30.17 
 
 
1008 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  30.17 
 
 
1008 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  36.17 
 
 
2882 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0021  pesticin  28.57 
 
 
357 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.750323  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0007  pesticin  28.57 
 
 
357 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112425  normal  0.0257696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2024  hypothetical protein  29.6 
 
 
242 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0118072  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1742  hypothetical protein  29.37 
 
 
242 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000391702  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2654  hypothetical protein  26.19 
 
 
334 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  35.96 
 
 
739 aa  44.3  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  41.07 
 
 
739 aa  44.3  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>