15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3854 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3854  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 123 aa  256  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0467  putative cytoplasmic protein  49.18 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3260  putative cytoplasmic protein  56.36 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2617  hypothetical protein  45.97 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2728  hypothetical protein  45.97 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2093  hypothetical protein  44.72 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2564  hypothetical protein  45.97 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  42.96 
 
 		 697 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2024  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0118072  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1742  hypothetical protein  40.86 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000391702  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1345  hypothetical protein  43.18 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2604  hypothetical protein  45.21 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  33.96 
 
 		 1008 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  33.96 
 
 		 1008 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0532  hypothetical protein  42.86 
 
 		 241 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000569067  unclonable  0.00000000103423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>