13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5210 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  100 
 
 
310 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  97.1 
 
 
310 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  87.72 
 
 
674 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  64.23 
 
 
792 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  47.12 
 
 
697 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4026  EF hand domain-containing protein  47.62 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  32.34 
 
 
889 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5209  hypothetical protein  61.25 
 
 
392 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01469  hypothetical protein  28.32 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 
1054 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  31.53 
 
 
989 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  30.91 
 
 
964 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  30.71 
 
 
931 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal 
 
 
-
 
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