53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0527 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 960 aa  2000    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  65.5 
 
 		 969 aa  1309    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  90.86 
 
 		 963 aa  1806    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  48.35 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  30.73 
 
 		 859 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06795  hypothetical protein  29.9 
 
 		 409 aa  112  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  27.42 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 485 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  29.02 
 
 		 675 aa  100  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  29.79 
 
 		 802 aa  99.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  26.49 
 
 		 739 aa  97.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  28.66 
 
 		 1118 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.38 
 
 		 698 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  28.42 
 
 		 453 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1409 aa  90.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  28.28 
 
 		 436 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.68 
 
 		 435 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  31.39 
 
 		 522 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  28.53 
 
 		 494 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  27.78 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  27.94 
 
 		 686 aa  86.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  27.72 
 
 		 436 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  28.62 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  27.22 
 
 		 726 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  26.9 
 
 		 768 aa  78.2  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.13 
 
 		 733 aa  77  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  27.79 
 
 		 815 aa  73.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  26.85 
 
 		 577 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  26.85 
 
 		 577 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  26.98 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  26.85 
 
 		 577 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  31.07 
 
 		 791 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  27.04 
 
 		 1892 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.62 
 
 		 462 aa  67  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  28.31 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  30.41 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.98 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  30.2 
 
 		 357 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  29.33 
 
 		 802 aa  55.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  29.33 
 
 		 769 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  29.33 
 
 		 769 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  29.33 
 
 		 802 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  28.8 
 
 		 740 aa  53.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  36.19 
 
 		 306 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  30.82 
 
 		 720 aa  51.6  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 		 456 aa  51.6  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  23.66 
 
 		 882 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1338 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  21.9 
 
 		 349 aa  47  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  27.56 
 
 		 341 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  27.22 
 
 		 530 aa  45.8  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  28.39 
 
 		 349 aa  44.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>