89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1842 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  613  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  42.68 
 
 
392 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  42.5 
 
 
387 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  43.24 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.85 
 
 
266 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.23 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
575 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  44.07 
 
 
358 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.19 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.96 
 
 
395 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.91 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 
128 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  39.02 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
395 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.97 
 
 
163 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.55 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  31.07 
 
 
739 aa  49.7  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  34.57 
 
 
234 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.8 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3449  hypothetical protein  33.62 
 
 
122 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.62 
 
 
792 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.84 
 
 
422 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.19 
 
 
447 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.51 
 
 
629 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  40 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.2 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  43.33 
 
 
2277 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  32.1 
 
 
739 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
383 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
232 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  35.58 
 
 
204 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  37.04 
 
 
228 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
327 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
254 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
246 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  33.75 
 
 
462 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  35.8 
 
 
1017 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  35 
 
 
242 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.25 
 
 
157 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.23 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 
433 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  37.5 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.86 
 
 
225 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  40.3 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  36.36 
 
 
519 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2906  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.28 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  41.79 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.84 
 
 
549 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  40 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  35.06 
 
 
406 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  34.95 
 
 
383 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  40.62 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 
635 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  42.42 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.35 
 
 
182 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0291  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.93701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.33 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40.68 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.3 
 
 
665 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  41.38 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
554 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  38.33 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.06 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  40 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  40 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.67 
 
 
1089 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  41.67 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  41.38 
 
 
379 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>