60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0153 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 665 aa  1365    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.03 
 
 		 1089 aa  62  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  40.4 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2435  putative lipase  38.58 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.619441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1321  hypothetical protein  29.76 
 
 		 983 aa  54.7  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.06 
 
 		 549 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03925  hypothetical protein  54.9 
 
 		 84 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.47 
 
 		 283 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  45.45 
 
 		 228 aa  51.2  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 635 aa  50.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 560 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.74 
 
 		 382 aa  50.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 560 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.24 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  41.25 
 
 		 270 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 433 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.58 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  42.68 
 
 		 242 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  40.26 
 
 		 202 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.5 
 
 		 228 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.75 
 
 		 239 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  35.8 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  37.76 
 
 		 1017 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 560 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.12 
 
 		 245 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.12 
 
 		 200 aa  48.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 275 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 321 aa  48.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 		 667 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 256 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 249 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 340 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 		 340 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  60 
 
 		 268 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 575 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 		 224 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 77 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.52 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 733 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 128 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 317 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.62 
 
 		 234 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  40.51 
 
 		 225 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 274 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  44.83 
 
 		 276 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  42.37 
 
 		 383 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 163 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  49.09 
 
 		 241 aa  45.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 215 aa  44.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.23 
 
 		 326 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.79 
 
 		 309 aa  44.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.31 
 
 		 242 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 232 aa  44.3  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  41.67 
 
 		 409 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  36.25 
 
 		 340 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.21 
 
 		 391 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  48 
 
 		 313 aa  43.9  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1583  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.33 
 
 		 360 aa  43.9  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>