15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2435 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2435  putative lipase  100 
 
 
442 aa  903    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.619441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05456  lipase family  63.39 
 
 
312 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03925  hypothetical protein  66.15 
 
 
84 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  33.54 
 
 
335 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0384  hypothetical protein  35.66 
 
 
355 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.24 
 
 
665 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1040  hypothetical protein  28.74 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1197  hypothetical protein  25.42 
 
 
462 aa  53.5  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0385  hypothetical protein  40.57 
 
 
138 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00108  hypothetical protein  44.87 
 
 
121 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04586  hypothetical protein  40.58 
 
 
132 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2717  hypothetical protein  28 
 
 
498 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00657711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.79 
 
 
2413 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1170  methyltransferase small  27.56 
 
 
1197 aa  44.3  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0959  hypothetical protein  29.09 
 
 
1079 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.36897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>