162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2392 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  84.31 
 
 		 571 aa  975    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  95.71 
 
 		 560 aa  1107    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 560 aa  1153    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  93.75 
 
 		 560 aa  1054    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.38 
 
 		 566 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.59 
 
 		 565 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.33 
 
 		 560 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  35.25 
 
 		 546 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  34.01 
 
 		 563 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.79 
 
 		 563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  35.59 
 
 		 563 aa  302  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.13 
 
 		 560 aa  294  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.78 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 559 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  32.36 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.36 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 544 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.2 
 
 		 547 aa  270  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.88 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  32.84 
 
 		 598 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  32.28 
 
 		 554 aa  257  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 		 549 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  29.93 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 556 aa  250  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  35.78 
 
 		 537 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  32 
 
 		 558 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 540 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  29.8 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 625 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  33.2 
 
 		 568 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.03 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  31.26 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.91 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 516 aa  227  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  32.48 
 
 		 540 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  30.45 
 
 		 607 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.37 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  28.85 
 
 		 561 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.52 
 
 		 599 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.29 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  36.16 
 
 		 502 aa  213  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 		 533 aa  213  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  39.64 
 
 		 318 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.77 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  32.36 
 
 		 564 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  28.19 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  29.31 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  28.19 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  28.14 
 
 		 616 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.54 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  28.38 
 
 		 661 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  28.19 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.34 
 
 		 571 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  28.47 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  29.47 
 
 		 576 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.79 
 
 		 629 aa  203  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 443 aa  203  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.3 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  28.34 
 
 		 618 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  28.34 
 
 		 618 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.81 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  28.34 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 646 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  28.27 
 
 		 575 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.36 
 
 		 648 aa  200  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.96 
 
 		 668 aa  200  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  28.52 
 
 		 615 aa  200  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  28.16 
 
 		 611 aa  200  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.52 
 
 		 615 aa  199  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  28.52 
 
 		 615 aa  199  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  28.52 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  28.52 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  28.52 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  28.02 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  28.52 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 399 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  29.11 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 558 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.88 
 
 		 637 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  32.01 
 
 		 519 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  30.69 
 
 		 572 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  28.33 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.7 
 
 		 534 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.79 
 
 		 662 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.14 
 
 		 426 aa  193  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.29 
 
 		 636 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 672 aa  193  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  27.07 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>