31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00543 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1780    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  39.1 
 
 		 416 aa  247  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  38.1 
 
 		 415 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  30.88 
 
 		 969 aa  219  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02008  hypothetical protein  94.12 
 
 		 133 aa  203  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  30.96 
 
 		 963 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  30.73 
 
 		 960 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  52.38 
 
 		 601 aa  191  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  33.41 
 
 		 593 aa  187  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  44.19 
 
 		 643 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  41.46 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  39.35 
 
 		 731 aa  155  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  39.61 
 
 		 656 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  37.38 
 
 		 655 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06795  hypothetical protein  28.71 
 
 		 409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  35.4 
 
 		 758 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  26.21 
 
 		 739 aa  131  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1409 aa  124  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  27.87 
 
 		 739 aa  120  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  30.53 
 
 		 546 aa  97.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  34.9 
 
 		 862 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  45.36 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 83 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  25.67 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  26 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  25.17 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  30.85 
 
 		 106 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2282  hypothetical protein  25.26 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1233  hypothetical protein  25.1 
 
 		 395 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0876385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  30.86 
 
 		 592 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1293  hypothetical protein  43.64 
 
 		 73 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00285181  normal  0.594635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>