12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1293 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1293  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00285181  normal  0.594635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  47.83 
 
 		 416 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  47.73 
 
 		 789 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  43.64 
 
 		 859 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  43.48 
 
 		 593 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  40.35 
 
 		 758 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  43.18 
 
 		 656 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  41.3 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  38.64 
 
 		 601 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  40.91 
 
 		 643 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  42.86 
 
 		 561 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  39.13 
 
 		 731 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>