26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5397 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  100 
 
 		 789 aa  1599    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  58.01 
 
 		 643 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  45.12 
 
 		 731 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  35.99 
 
 		 758 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  45.08 
 
 		 656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  37.38 
 
 		 655 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  30.47 
 
 		 601 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  36.91 
 
 		 678 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  41.38 
 
 		 459 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  41.46 
 
 		 859 aa  163  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  36.58 
 
 		 415 aa  162  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  36.02 
 
 		 416 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  35 
 
 		 593 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  28.21 
 
 		 862 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  37.18 
 
 		 740 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  35.32 
 
 		 791 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  34.62 
 
 		 559 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0912  S-type pyocin  36.73 
 
 		 245 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  29.11 
 
 		 480 aa  94  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  29.11 
 
 		 612 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  29.3 
 
 		 578 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  37.62 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  27.78 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  48.68 
 
 		 83 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1293  hypothetical protein  47.73 
 
 		 73 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00285181  normal  0.594635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  30.93 
 
 		 106 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>