25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1306 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  100 
 
 		 758 aa  1546    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  32.95 
 
 		 789 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  39.2 
 
 		 643 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0912  S-type pyocin  50.67 
 
 		 245 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  35.17 
 
 		 731 aa  193  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  33.14 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  37.62 
 
 		 656 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  36.34 
 
 		 655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  38.03 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  35.4 
 
 		 859 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  39.05 
 
 		 415 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  33.33 
 
 		 593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  33.88 
 
 		 459 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  30.65 
 
 		 791 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  30.43 
 
 		 612 aa  84  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  36.11 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  30.82 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  30.9 
 
 		 678 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  25.82 
 
 		 862 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  34.81 
 
 		 740 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  29.88 
 
 		 559 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  46.05 
 
 		 83 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  34.74 
 
 		 106 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  31.75 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1293  hypothetical protein  40.35 
 
 		 73 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00285181  normal  0.594635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>