23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  87.42 
 
 		 740 aa  1065    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  100 
 
 		 791 aa  1594    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  96.52 
 
 		 559 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  36.97 
 
 		 862 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  36.36 
 
 		 789 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  33.67 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  34.66 
 
 		 643 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  30.89 
 
 		 678 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59220  pyocin S5  43.36 
 
 		 498 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000328574  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  35 
 
 		 655 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  35.45 
 
 		 656 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  30.65 
 
 		 758 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  30.15 
 
 		 612 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  29.32 
 
 		 731 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  29.78 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  29.52 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  30.92 
 
 		 593 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  30.43 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0532  S-type pyocin domain-containing protein  30.87 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  30.54 
 
 		 510 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  30.54 
 
 		 510 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  30.54 
 
 		 512 aa  48.9  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  22.71 
 
 		 1675 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.401487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>