22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  100 
 
 		 559 aa  1109    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  96.52 
 
 		 791 aa  801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  78.35 
 
 		 740 aa  784    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  36.27 
 
 		 789 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  33.59 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  33.79 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  30.65 
 
 		 678 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  34.95 
 
 		 655 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  35.44 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  34.42 
 
 		 731 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  31.12 
 
 		 758 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  30.68 
 
 		 612 aa  80.5  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  30.49 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  30 
 
 		 601 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  29.64 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0532  S-type pyocin domain-containing protein  32.3 
 
 		 652 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  30.11 
 
 		 578 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  28.05 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  28.65 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  28.65 
 
 		 510 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  29.21 
 
 		 512 aa  44.3  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  26.1 
 
 		 862 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>