20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4050 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  99.79 
 
 		 480 aa  992    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  100 
 
 		 612 aa  1266    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  93.07 
 
 		 601 aa  938    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  37.6 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  33.39 
 
 		 678 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  45.83 
 
 		 578 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0494  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.557626  normal  0.0118474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  43.85 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4511  hypothetical protein  41.67 
 
 		 235 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  33.46 
 
 		 740 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  30.15 
 
 		 791 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  31.91 
 
 		 643 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  29.76 
 
 		 789 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  30.61 
 
 		 559 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0532  S-type pyocin domain-containing protein  29.32 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  29.54 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  29.66 
 
 		 593 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  26.59 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  31.48 
 
 		 2942 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  26.37 
 
 		 656 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>