22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3037 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  100 
 
 		 740 aa  1485    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  87.42 
 
 		 791 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  78.35 
 
 		 559 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0532  S-type pyocin domain-containing protein  38.32 
 
 		 652 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  38.38 
 
 		 789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  35.6 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  32.5 
 
 		 459 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  31.58 
 
 		 612 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  31.01 
 
 		 601 aa  94.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  31.08 
 
 		 678 aa  94  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  31.25 
 
 		 480 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59220  pyocin S5  45 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000328574  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  30.45 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  33.49 
 
 		 655 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  33.49 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  34.81 
 
 		 758 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  32.84 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  33.04 
 
 		 578 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  25.4 
 
 		 512 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  24.7 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  28.48 
 
 		 505 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  24.7 
 
 		 510 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>