27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5377 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  100 
 
 		 505 aa  1031    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  28.86 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  32.18 
 
 		 731 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  30.46 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0497  colicin-E7 immunity protein  37.93 
 
 		 85 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4047  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  37.93 
 
 		 85 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0165  colicin/pyocin immunity family protein  43.75 
 
 		 84 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4760  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  36.05 
 
 		 89 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0117  putative colicin immunity protein  32.26 
 
 		 94 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4420  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  32.95 
 
 		 87 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1305  Pyocin S-type immunity protein, putative  32.95 
 
 		 87 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00542  hypothetical protein  35.37 
 
 		 85 aa  57.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5233  colicin/pyocin immunity family protein  32.61 
 
 		 90 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3287  colicin-E7 immunity protein  31.52 
 
 		 92 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.918498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0309  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  30.43 
 
 		 90 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5395  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  35.29 
 
 		 86 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  hitchhiker  0.00565903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  24.71 
 
 		 655 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  25.29 
 
 		 656 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0121  putative colicin immunity protein  40.74 
 
 		 98 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974645  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5396  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  30.12 
 
 		 85 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576115  hitchhiker  0.00133888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4544  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  28.89 
 
 		 85 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4652  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  30.11 
 
 		 91 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4762  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  29.41 
 
 		 84 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  28.48 
 
 		 740 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0119  putative colicin immunity protein  26.88 
 
 		 96 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5448  colicin/pyocin immunity family protein  29.79 
 
 		 91 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501372  normal  0.021429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  26.38 
 
 		 559 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>