25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0883 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  85.81 
 
 		 459 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  100 
 
 		 678 aa  1371    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  48.61 
 
 		 643 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  48.17 
 
 		 578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  34.16 
 
 		 612 aa  253  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  37.99 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1036  hypothetical protein  81.46 
 
 		 153 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  37.04 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4511  hypothetical protein  43.7 
 
 		 235 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  42.98 
 
 		 386 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  27.08 
 
 		 731 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  33.07 
 
 		 740 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  33.73 
 
 		 791 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  33.6 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  27.21 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  31.55 
 
 		 758 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  31.95 
 
 		 655 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  32.35 
 
 		 656 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.67 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.32 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  26.41 
 
 		 862 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.97 
 
 		 2942 aa  50.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 643 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  34.09 
 
 		 2196 aa  47.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  27.08 
 
 		 2400 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>