30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4651 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  100 
 
 
643 aa  1279    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  51.28 
 
 
789 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  50.09 
 
 
678 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  36.93 
 
 
731 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  32.31 
 
 
655 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  43.03 
 
 
656 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  35.82 
 
 
601 aa  233  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  39.35 
 
 
758 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  42.06 
 
 
459 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1036  hypothetical protein  61.59 
 
 
153 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  44.19 
 
 
859 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  37.54 
 
 
593 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  32.54 
 
 
416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  32.77 
 
 
415 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  30.26 
 
 
862 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  34.9 
 
 
740 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  33.98 
 
 
791 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  32.95 
 
 
559 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  31.9 
 
 
612 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  32.42 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  42.57 
 
 
561 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  50 
 
 
83 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  30.45 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  30.46 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  34.44 
 
 
106 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  37.96 
 
 
2196 aa  50.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.36 
 
 
643 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.07 
 
 
561 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  49.38 
 
 
334 aa  43.9  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  51.39 
 
 
332 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>