11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2629 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 1101 aa  2279    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0266  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1100 aa  131  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0987529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1143  hypothetical protein  26.7 
 
 		 697 aa  131  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0264  hypothetical protein  25.97 
 
 		 543 aa  89.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1140  hypothetical protein  25.53 
 
 		 538 aa  87.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1142  hypothetical protein  25.15 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  25.35 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1192  hypothetical protein  22.1 
 
 		 887 aa  64.7  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04701  DNA repair ATPase  23.31 
 
 		 975 aa  59.3  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_38  putative cell wall degradation protein  23.47 
 
 		 814 aa  47  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 		 744 aa  45.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>