More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0326 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  100 
 
 
372 aa  695    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.13 
 
 
568 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  32.19 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  31.47 
 
 
602 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  34.94 
 
 
338 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
341 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  34.54 
 
 
499 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  33.16 
 
 
390 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  30.83 
 
 
314 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 
445 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  40.1 
 
 
361 aa  94  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  29.44 
 
 
399 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  34 
 
 
515 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34 
 
 
515 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  28.77 
 
 
307 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  36.98 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  30.77 
 
 
515 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.66 
 
 
515 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.66 
 
 
519 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  30.85 
 
 
440 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.5 
 
 
515 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  29.86 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  30.58 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.16 
 
 
515 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0324  muramidase  50.41 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.05 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  28.84 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.05 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.37 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  27.75 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  38.35 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  47.06 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  41.01 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 
797 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.03 
 
 
544 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.5 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  28.44 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  37.59 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  31.66 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  30.81 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 
517 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  36.5 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  36.5 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  31.31 
 
 
511 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  27.96 
 
 
661 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.21 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  30.96 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  24.79 
 
 
612 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  28.64 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  24.79 
 
 
612 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.21 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  28.7 
 
 
580 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.33 
 
 
1001 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  35.68 
 
 
1021 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  33.16 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  27.49 
 
 
546 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  25.7 
 
 
539 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.43 
 
 
617 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  27.85 
 
 
509 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.36 
 
 
554 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  33.17 
 
 
1079 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  32.31 
 
 
503 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 
547 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  29.19 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  31.1 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  35 
 
 
1556 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  38.41 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  27.5 
 
 
518 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.27 
 
 
515 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  26.04 
 
 
647 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  34.51 
 
 
142 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  29.5 
 
 
587 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  27.19 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  28.21 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  34.33 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  27 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  35.21 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  32.39 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  32.39 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  28.84 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  37.7 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  25.35 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  33.1 
 
 
483 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  24.64 
 
 
543 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  34.51 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  34.51 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  29.94 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.11 
 
 
552 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  27.03 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  25.45 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  33.9 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  29.51 
 
 
498 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  25.85 
 
 
849 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  31.62 
 
 
477 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  25.94 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  27.6 
 
 
524 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>