195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2827 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  57.45 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.26 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46 
 
 		 470 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  48.98 
 
 		 341 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 522 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 507 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  55.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  47.73 
 
 		 390 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  52.5 
 
 		 372 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 301 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.81 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  54.35 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 590 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  42.22 
 
 		 674 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 446 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.58 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  46.51 
 
 		 233 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  40.54 
 
 		 367 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  41.67 
 
 		 324 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 567 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  43.14 
 
 		 372 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  43.14 
 
 		 372 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.48 
 
 		 284 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 330 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  38.24 
 
 		 545 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  46.51 
 
 		 233 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  46.51 
 
 		 233 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  28.95 
 
 		 277 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  46.51 
 
 		 240 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  34.92 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  47.83 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  45.45 
 
 		 405 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  46.51 
 
 		 230 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  44.68 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 530 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  40.43 
 
 		 432 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 422 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  37.5 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.73 
 
 		 797 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  33.96 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  34.33 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 539 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  38.46 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  42.86 
 
 		 429 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  45.24 
 
 		 332 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.75 
 
 		 289 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  32.22 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  42.86 
 
 		 448 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  26.47 
 
 		 246 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  30.91 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  46.51 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  26.39 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  37.5 
 
 		 419 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  47.27 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  46.77 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  45.45 
 
 		 236 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  46.51 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  46.51 
 
 		 426 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 503 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.51 
 
 		 509 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 733 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.04 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 709 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.55 
 
 		 568 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 		 445 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  38.3 
 
 		 604 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 333 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  43.18 
 
 		 428 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 423 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  42.22 
 
 		 424 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1088  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  37.78 
 
 		 216 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  42 
 
 		 404 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  40 
 
 		 613 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  38.3 
 
 		 631 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  42 
 
 		 404 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  39.53 
 
 		 503 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 		 546 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.44 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>