More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4066 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
390 aa  764    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  50.95 
 
 
399 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  50.53 
 
 
440 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  44.29 
 
 
445 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 
390 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  41.69 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  33.58 
 
 
390 aa  173  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 
661 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  31 
 
 
327 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31.55 
 
 
324 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  33.16 
 
 
372 aa  96.3  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  31.44 
 
 
596 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.37 
 
 
514 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.39 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 
733 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.55 
 
 
1001 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  32.12 
 
 
515 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 
595 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.12 
 
 
515 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  32.47 
 
 
1021 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.57 
 
 
568 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.18 
 
 
304 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  32.12 
 
 
515 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.19 
 
 
544 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  31 
 
 
695 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.65 
 
 
797 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  28.38 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  31.41 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  31.96 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  28.5 
 
 
602 aa  83.2  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  30.73 
 
 
515 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.57 
 
 
515 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  30.73 
 
 
515 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  30.73 
 
 
519 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  32.98 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  48.31 
 
 
557 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  30.21 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  45.9 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.08 
 
 
637 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.1 
 
 
631 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.1 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  34.95 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  26.76 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  26.76 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  43.93 
 
 
560 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  33.51 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  44.9 
 
 
563 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  27.08 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  25.4 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  26.96 
 
 
849 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.75 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  29.46 
 
 
587 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.29 
 
 
620 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.02 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.56 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  35.88 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.03 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.6 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  29.23 
 
 
1079 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.88 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  25.75 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  36.3 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  35.71 
 
 
483 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  31.34 
 
 
498 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  29.32 
 
 
173 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  37.12 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  33.55 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.61 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  34.56 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 
539 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  35 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25.64 
 
 
509 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.25 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  26.51 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  35 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  35 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  34.01 
 
 
580 aa  70.1  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  29.94 
 
 
571 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.04 
 
 
552 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  36.28 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 
142 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  26.94 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.25 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  27.93 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  32.35 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.61 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.91 
 
 
1556 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  37.96 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  29.03 
 
 
546 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  36.76 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  28.42 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>