10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04701 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04701  DNA repair ATPase  100 
 
 
975 aa  2021    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04717  DNA repair ATPase  96.01 
 
 
515 aa  857    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04715  DNA repair ATPase  93.81 
 
 
226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05512  DNA repair ATPase  94.41 
 
 
182 aa  325  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.277469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04720  DNA repair ATPase  91.3 
 
 
188 aa  308  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0233967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  26.15 
 
 
709 aa  73.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2629  hypothetical protein  23.55 
 
 
1101 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  28.66 
 
 
744 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_38  putative cell wall degradation protein  23.26 
 
 
814 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0266  hypothetical protein  21.3 
 
 
1100 aa  45.8  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0987529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>