86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0889 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0889  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000446725 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  43.64 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  43.64 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  43.64 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  43.64 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  44.44 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  48.89 
 
 		 499 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.68 
 
 		 443 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  49.09 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  51.11 
 
 		 179 aa  48.9  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 524 aa  48.5  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  46.67 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  46.67 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  46.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  42.55 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  42.55 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  46.67 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  46.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  46.67 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  46.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  46.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  50 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  47.73 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  46.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  45.45 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  40.43 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  40.43 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  40.43 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  41.51 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  46.67 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.51 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  40.43 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  37.74 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  44.68 
 
 		 367 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  38.71 
 
 		 1556 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 409 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.43 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.43 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  40.43 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  40.43 
 
 		 296 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1083  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.53 
 
 		 506 aa  45.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.91418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.43 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  40.43 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.43 
 
 		 296 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 647 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  38.3 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  44.68 
 
 		 538 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.6 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  40.74 
 
 		 509 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 503 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  38.18 
 
 		 602 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 520 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  43.14 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  44.44 
 
 		 515 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.91 
 
 		 568 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  44.44 
 
 		 534 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  42.86 
 
 		 530 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  35.85 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0471  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 398 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  46.67 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  36.07 
 
 		 503 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  42.22 
 
 		 367 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  42.22 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  51.11 
 
 		 341 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 422 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0436  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 371 aa  42.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.780334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 466 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 571 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  44.9 
 
 		 534 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  39.22 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  39.13 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 168 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.48 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.62 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  42.31 
 
 		 248 aa  42  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 567 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  34.78 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 338 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 590 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  40 
 
 		 303 aa  42  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40 
 
 		 517 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  50 
 
 		 279 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 390 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  50 
 
 		 279 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>