33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0436 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0436  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 371 aa  742    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.780334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0471  peptidoglycan-binding LysM  77.78 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  59.02 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  52.17 
 
 		 1001 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  51.11 
 
 		 1079 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  39.73 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 1021 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  38.89 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  28.57 
 
 		 751 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  31.87 
 
 		 264 aa  46.2  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  41.3 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  28.07 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  39.34 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  33.87 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  33.87 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  33.87 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  42.22 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  38.78 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.67 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  41.3 
 
 		 449 aa  42.7  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>