60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0193 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 536 aa  1080    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  34.59 
 
 		 567 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  31.79 
 
 		 545 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.43 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  27.93 
 
 		 530 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  32.97 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  24.01 
 
 		 522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  21.98 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  22.18 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  22.38 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  21.86 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  23.06 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  21.67 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  23.14 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2271  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.76 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  42.5 
 
 		 173 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  43.75 
 
 		 278 aa  57  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2272  hypothetical protein  37.66 
 
 		 174 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2270  hypothetical protein  30.84 
 
 		 156 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  40.68 
 
 		 179 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.26 
 
 		 289 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  18.75 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  40.43 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48 
 
 		 230 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 156 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 191 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  46.81 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0471  peptidoglycan-binding LysM  40.28 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  41.67 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  44.68 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 221 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.13 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 		 210 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 112 aa  47.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  44.19 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  41.18 
 
 		 328 aa  47  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.67 
 
 		 470 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 185 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000216778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  42.55 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.38 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 327 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  46.67 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 555 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  38 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  43.48 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  47.17 
 
 		 1001 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  39.13 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 507 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 590 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0436  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.780334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  45.28 
 
 		 1021 aa  43.9  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  41.86 
 
 		 262 aa  43.9  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 498 aa  43.9  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  46 
 
 		 663 aa  43.5  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>