223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1069 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 168 aa  317  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  80.56 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  54.87 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  46.49 
 
 		 132 aa  94.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  51.06 
 
 		 788 aa  58.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  31.82 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  47.13 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.59 
 
 		 751 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  56.36 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  43.14 
 
 		 310 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  34.74 
 
 		 727 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  53.33 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  34.74 
 
 		 727 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 422 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  51.85 
 
 		 445 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  43.3 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  44.83 
 
 		 305 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  41.67 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  52 
 
 		 414 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 500 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.03 
 
 		 433 aa  50.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  37.5 
 
 		 253 aa  50.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.11 
 
 		 293 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  29.25 
 
 		 315 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 466 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 590 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  37.76 
 
 		 438 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  42.59 
 
 		 447 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 754 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5051  Peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  30.82 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  51.11 
 
 		 428 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 109 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 427 aa  48.9  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  45.9 
 
 		 261 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 		 286 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.55 
 
 		 230 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  44.44 
 
 		 274 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.67 
 
 		 470 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  44 
 
 		 295 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 530 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 583 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  44.44 
 
 		 301 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.14 
 
 		 304 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 314 aa  47.8  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  48.84 
 
 		 430 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  44.44 
 
 		 372 aa  47.4  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.28 
 
 		 233 aa  47.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36.76 
 
 		 341 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  39.22 
 
 		 503 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  39.62 
 
 		 284 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  44 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  41.18 
 
 		 262 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 522 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  45.65 
 
 		 587 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  40.35 
 
 		 397 aa  47  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  46.94 
 
 		 530 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.78 
 
 		 274 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  47.92 
 
 		 474 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  30.61 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  50 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  44.44 
 
 		 295 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  46.94 
 
 		 1556 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  44.9 
 
 		 534 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  44.44 
 
 		 295 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  35.53 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  31.67 
 
 		 253 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  44 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.89 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.13 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  38.3 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  59.09 
 
 		 509 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.44 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000216778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  41.89 
 
 		 546 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  35.38 
 
 		 351 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  45.45 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  45.24 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  44.44 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  42 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  44.44 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.44 
 
 		 236 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  44.44 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  44.44 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.44 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  44.44 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  44.44 
 
 		 233 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  44.44 
 
 		 298 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 596 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.44 
 
 		 233 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>