40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0297 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  43.65 
 
 		 136 aa  119  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  44.54 
 
 		 126 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  36.75 
 
 		 579 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  34.82 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  46.84 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  41.03 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  44.44 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  45 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  45 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  41.18 
 
 		 500 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  39.74 
 
 		 575 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  43.21 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  36.94 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  43.21 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  40.26 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  46.34 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  44.87 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  36.54 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  41.56 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  35.96 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  44.87 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  37.78 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  34.23 
 
 		 577 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  38.96 
 
 		 642 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  38.37 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  42.86 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  37.5 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  40.51 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  34.15 
 
 		 662 aa  55.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  30.48 
 
 		 576 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93578  predicted protein  40.54 
 
 		 686 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000533165  normal  0.01596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  40.3 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  34.78 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  40.32 
 
 		 1319 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  39.24 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  31.25 
 
 		 505 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  34.04 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  35.56 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  33.71 
 
 		 172 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>