21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2566 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  88.58 
 
 		 438 aa  811    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  100 
 
 		 438 aa  894    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.33 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  26.74 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  24.69 
 
 		 814 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.96 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.97 
 
 		 182 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.18 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 667 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  41.18 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 1089 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.75 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3610  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 155 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108072  normal  0.729996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  40.28 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 251 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.68 
 
 		 323 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>