125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0199 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  90.23 
 
 		 266 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  61.83 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  62.26 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  53.16 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.47 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  42.17 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.58 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  40.84 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  39.38 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  32.12 
 
 		 946 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.15 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  40.72 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  29.55 
 
 		 424 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  35.03 
 
 		 404 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  30.65 
 
 		 457 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.52 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  33.16 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  30.35 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.52 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.46 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.72 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  31.28 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 629 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.03 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  28.24 
 
 		 459 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  29.63 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.45 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  36.84 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 1089 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  34.91 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  41.67 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.25 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 554 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.42 
 
 		 379 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.54 
 
 		 447 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 974 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.67 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  42.19 
 
 		 462 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.75 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0729  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 		 532 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  42.19 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  43.24 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.55 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.37 
 
 		 201 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 559 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.47 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  37.1 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  43.75 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.54 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.04 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.03 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  45.61 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.41 
 
 		 792 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 170 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.1 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.85 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.07 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.79 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.46 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 412 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.08 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  43.64 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40.91 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  42.31 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  35.16 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.35 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0091  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.337262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>