36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4510 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  792    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  43.13 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  41.95 
 
 		 258 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  39.06 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 268 aa  116  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.85 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  33 
 
 		 274 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  34.76 
 
 		 267 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  39.23 
 
 		 268 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  31.46 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  34.83 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  36.32 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  27.46 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0662  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  45.57 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  26.9 
 
 		 946 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  30.07 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  25.24 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  25.73 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2233  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  45.45 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  43.06 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.39 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0927  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000328138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  32.04 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>