24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0893 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 430 aa  852    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.75 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4048  hypothetical protein  37.89 
 
 		 479 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.422059  normal  0.0578992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1255  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.54 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.581168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1880  hypothetical protein  45.65 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0529  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  51.92 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 589 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  41.27 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  43.75 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  41.82 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  37.84 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  41.82 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  40.98 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.1 
 
 		 251 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  30.59 
 
 		 470 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 585 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>