79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0052 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  685    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.52 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.3 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  70.82 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.82 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  67.37 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  70.04 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 273 aa  276  5e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  44.28 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.98 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  44.89 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  39.93 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  44.13 
 
 		 275 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  45.74 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  43.66 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  43.81 
 
 		 275 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  36.29 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  36.76 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  37.72 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  38.03 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  41.73 
 
 		 217 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  32.42 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  27.43 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  45.33 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  42.03 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  42.59 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  38.71 
 
 		 478 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 667 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 469 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 469 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 469 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 478 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 478 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 478 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  70.59 
 
 		 61 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  50.98 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 465 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.55 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  40.3 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  34.75 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  33.85 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  43.14 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  29.93 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3176  hypothetical protein  28.31 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  37.04 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  49.06 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 997 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 1072 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  37.5 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  47.06 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 1012 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 635 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  44.19 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  44.19 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 508 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 488 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 430 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>