17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04286 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  43.27 
 
 
316 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  35.71 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.5 
 
 
346 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.5 
 
 
346 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 
273 aa  62  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.96 
 
 
299 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  34.31 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  43.18 
 
 
277 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.57 
 
 
344 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
311 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  35 
 
 
356 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  35 
 
 
346 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  37.59 
 
 
271 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  31.69 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3176  hypothetical protein  54.05 
 
 
308 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  30.82 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>