29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0875 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  98.88 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  78.54 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  80.82 
 
 		 270 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.95 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 312 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.28 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.09 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.94 
 
 		 346 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 346 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 356 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 346 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  31.58 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  32.44 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  28.04 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  28.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  28.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  28.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  28.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  28.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  28.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  28.64 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  29.36 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  29.22 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  31.69 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>