30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3710 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.26 
 
 		 273 aa  258  9e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  50.58 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.69 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.38 
 
 		 344 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.63 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.31 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.31 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.72 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.53 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  44.06 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  42.72 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  44.14 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  40.16 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  43.19 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  36.48 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  42.25 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  36.11 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  36.11 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  36.63 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  31.44 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  30.24 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  34.53 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  64.71 
 
 		 61 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>