31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2037 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  55.73 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.75 
 
 
299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.37 
 
 
344 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.62 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.94 
 
 
312 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.36 
 
 
346 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.36 
 
 
346 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.87 
 
 
346 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.09 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  42.32 
 
 
268 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  36.43 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  39.81 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  43.11 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  38.33 
 
 
271 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  37.5 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  40.28 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  37.72 
 
 
267 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  37 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  38.81 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  27.35 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  55.88 
 
 
61 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  33.82 
 
 
305 aa  42  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>