29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0374 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  29.89 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  27.49 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  27.39 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  26.78 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  28 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  26.87 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  27.59 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  27.59 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  30.65 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  27.14 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  25.74 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  23.93 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  23.93 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  26.11 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  24.14 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  30.4 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  25.76 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  22.66 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  26.1 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0651  hypothetical protein  26.12 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  20.94 
 
 		 490 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  28.89 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  25.32 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  25.32 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 196 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  24.68 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 196 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  23.17 
 
 		 195 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>