31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0326 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  100 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  82.26 
 
 		 275 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  81.89 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  80.75 
 
 		 275 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  71.37 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  61.48 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  40.83 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.07 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.53 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.67 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.13 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.13 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.76 
 
 		 344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.5 
 
 		 356 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.5 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0637  hypothetical protein  70.67 
 
 		 105 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  30.17 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  30.17 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  32.42 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  38.69 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  29.57 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  80.56 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  25.5 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  26.45 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>