30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3384 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  45.91 
 
 
217 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.98 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.98 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.23 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.23 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.54 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  34.07 
 
 
267 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  34.07 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  29.56 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  33.19 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.35 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.98 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  30.46 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.02 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  31.74 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  30.88 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  30.81 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  29.56 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  29.56 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  29.56 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  29.56 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  29.56 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  29.56 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3176  hypothetical protein  26.21 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  28.64 
 
 
275 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  29.9 
 
 
277 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  28.86 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>