29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0804 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  98.88 
 
 
267 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  78.95 
 
 
271 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  80.82 
 
 
270 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.89 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.29 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  32.9 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 
312 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.72 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.09 
 
 
344 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.94 
 
 
346 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.06 
 
 
356 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.79 
 
 
346 aa  95.1  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  31.14 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  29.82 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  32.44 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  28.81 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  29.44 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  28.18 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  28.36 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  28.25 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  31.69 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>